適格請求書発行事業者の申請において電子情報処理組織（e-Tax）による通知を希望する場合、登録申請書の赤丸の箇所にチェックを入れて申請する必要があります。
チェックなしの場合は書面にて通知されます。
顧問先から、e-Taxの通知を確認したいという問い合わせが多いため、その確認方法を紹介します。
メッセージボックスの確認画面を下にスクロールし、「受付システムへログインする」をクリックします。
受付システム ログイン画面で、利用者識別番号と暗証番号を入力し、「ログイン」ボタンをクリックします。
メインメニュー画面の通知書等一覧の「確認画面へ」ボタンをクリックします。
通知書等一覧画面で、「適格請求書発行事業者通知書」を選択して「切替」ボタンをクリックします。
適格請求書発行事業者通知書のメッセージが届いている場合、画面下に表示されます。
登録申請書にチェックを入れなかった場合、表示されません。
メッセージの格納日の日付をクリックします。
適格請求書発行事業者通知書の状況画面が表示されます。
適格請求書発行事業者通知書を確認する場合、「適格請求書発行事業者通知書一覧へ」をクリックします。
適格請求書発行事業者通知書一覧画面の適格請求書発行事業者の登録通知書の「確認」ボタンをクリックすると、画面に通知書の内容が表示されますので、印刷やPDFに保存するなど対応してください。
※2022/04/19追記。
出典：e-Tax 国税電子申告・納税システム。